Pesantren Tahfizhul Quran (PTQ) Pondok Bambu memberikan kesempatan kepada para santri untuk mengikuti pendidikan formal (SMP PLUS dan SMA PLUS) yang mengacu kepada satuan pendidikan di bawah Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan. Selain ilmu-ilmu pengetahuan umum, pada program sekolah ini para santri mendapatkan pendidikan khas Pesantren seperti Ilmu Tauhid, Ilmu Fiqih, dan Akhlaq. Nilai Plus yang didapatkan para siswa SMP dan SMA Plus adalah pelajaran tambahan Bahasa Arab dan Inggris serta Tahsinul Quran dan Tahfizhul Quran.